总指挥官和最高领导人的集体被俘更加让拉萨城内外的藏军斗志烟消云散，在接到阿旺松绕下达的“不许开枪，向汉军投降”的命令后，所有的藏兵立刻全部放下了武器。下午3时整，东北军第45旅的第777摩托化步兵团在没有遇到抵抗的情况下缓缓地进入了拉萨城区，汉语和藏语的欢呼声中，青天白日满地红国旗和东北军的红底黑色战斧军旗一起飘扬在了这座世界之巅的城市上空，标志着拉萨和绝大部分的西藏地区就此解放，重新回归到了中国中央政府（东北边防政府）的控制和领导下。

回归祖国怀抱后的西藏，经过东北边防政府的申请和武汉中央国民政府的批准后新建为“中国西藏自治区”，首府城市定为拉萨市，全区的政务权事全部高度自治（重大事情需要和中央政府通报请示）。4月15日，武汉中央国民政府宣布追封已故的达赖十三世大师为“护国弘化普慈圆觉大师”，追封已故的班禅九世大师为“佑民慈悲妙玄仁光大师”，并高度地赞扬了这两位西藏佛宗教派领袖的伟大爱国高风亮节和生前为国家团结、西藏发展所做出的巨大贡献；国民政府承诺将保留并绝对尊重西藏人民的宗教信仰和西藏“金瓶擎签”的灵童转世制度，规定西藏地方政府的行政和宗教最高领导人为达赖喇嘛活佛和班禅额尔德尼活佛；同时任命摄政达扎阿旺松绕为西藏自治区主席，阿沛阿旺晋美和五世格达活佛佛洛桑登真扎巴他耶大师两人共同担任西藏自治区的副主席。

在重新整顿安排了西藏政权教权的结构框架后，东北军第256、第257、第258、第270山地作战师等部队逐步入驻拉萨城和西藏的各个边防地区，并全力进行剿灭叛乱的西藏土司、地主等旧贵族的军事行动，以确保了西藏牢牢地控制在中央（东北）政府的手里；同时东北军招募藏人组建西藏边防军（即新藏军）和西藏的警察部队，其中新藏军下辖5个高原山地作战旅，总兵力约4万人，正副总司令分别由阿沛阿旺晋美中将（由武汉军委会军政部新授予的）和荆德文少将担任。

4月27日，西藏自治区主席摄政达扎阿旺松绕、副主席阿沛阿旺晋美、自治区政府高层官员凯墨索安旺堆、桑颇丹增顿珠、土登旦达、土登列门等人以及藏佛教宗代表五世格达活佛洛桑登真扎巴他耶大师等人组成西藏代表团，应全国陆海空三军副总司令兼国防部长张学良上将的邀请分乘数架东北军的“鸬鹚”军用运输机抵达沈阳，进行友好访问并就西藏今后的发展等诸多问题展开协商讨论会议。

在沈阳，摄政达扎阿旺松绕、阿沛阿旺晋美、五世格达活佛等人受到了张学良的亲自迎接和东北军政高层以及东北人民的热烈欢迎。经过十多天友好商谈后，双方签订了《中国东北边防政府与西藏自治区政府和平协定》、《奉藏友好共同发展四十六条》等协议条约；期间，他们还参观了举世闻名的东北“1号”重工业区和东北鞍山第一钢铁厂，在工厂的生产流水线车间里，西藏代表团成员们可谓大开眼界，因为过去的西藏根本没有工业，哪怕小型的工厂也没有。阿旺晋美羡慕地问张学良：“张将军，西藏也能建设工厂吗？”

张学良坚定地道：“能！只要我们万众一心，就能实现。”他又推心置腹地娓娓讲解道，“想必你们已经看到了，除了传统的农业外，工业也是必须要大力发展的，这样才能让一个国家、一个地区强盛发达起来，让人民过上幸福的生活。西藏由于位处高原地区，严峻的气候和地理条件都不适合重工业的发展，但是可以兴建起轻工业和中小型工厂。西藏蕴含的自然资源十分丰富，并且拥有世界第一的太阳能资源和地热资源…哦，就是你们的那些温泉呀！这些自然条件都应该好好地充分利用起来，为西藏人民造福呀！还有，西藏目前的封建农奴制度是十分落后和野蛮的，它严重地阻碍西藏生产力的发展和社会的进步，窒息了西藏社会的生机和活力，虽然它能让少数的西藏上层贵族过着穷奢极欲的生活，但是却让广大藏族人民生活在水深火热的贫穷困苦不堪之中，使得西藏的社会日益走向没落和衰败。所以，在西藏进行土地改革和现代化的工业建设是必然的。”

张学良转过身，又对格达活佛扎巴他耶大师诚恳道：“西藏人都是信奉佛教的，佛教有云‘众生平等’，而且我佛是大慈大悲的。那西藏的那些农奴百姓也应该得到平等仁慈的对待呀，也应该得到自己的土地、自己的牛羊，以及医疗、教育等权益呀！怎么能让占西藏95%以上的人民都终日过着被剥削压榨日子呢？这些都不符合佛祖的‘众生平等’和‘大慈大悲’精神呀！其实，解放了农奴，就是解放了西藏的生产力，也就是解放了西藏呀！”

格达活佛听得微微动容，他双掌合十地钦佩道：“无量寿佛！张将军所言甚是呀！西藏的农奴制度确实必须要废止的。”

参观完东北的现代化重工企业和游览完沈阳大都市的繁华后，张学良还特地安排了西藏代表团观摩东北军的军事演习。大连军港演习场上，后方重炮群震天怒吼，炮弹铺天盖地飞啸而去，将远处的目标尽皆轰炸成火海；空中直升机和大批的战斗机编成战队穿云破雾、呼啸盘旋，用六管重机枪、空对地火箭弹以及航空炸弹漫山遍野地清除掉地面反抗的“敌方火力碉堡”；地面上，一排排杀气腾腾的“东北虎”主战坦克纵横如梭，飞沙走石和震天杀声中，全副现代化装备的东北军士兵龙骁虎猛地挺着精良的ak突击步枪冲锋扫射；海面上，一艘艘艨艟战舰乘风破浪、千帆竞就，一排排舰炮怒吼咆哮，震耳欲聋的爆炸声中，大片大片的海滩被笼罩在血火硝烟中......这一幕幕气吞山河的壮观场面更加让西藏代表团成员们惊叹不已，因为按照他们以前的观念，打仗比的就是人多和枪多，但现在见识了东北军现代化军队的陆海空三维立体火力打击的巨大威力后，顿时他们都觉得人再多也无济于事。尤其摄政达扎阿旺松绕，更加看得是惊心动魄，此时他愈发觉得自己当初要武力对抗东北军是一件多么荒唐可笑的决定了。

最后，张学良还热情地宴请了西藏代表团。在宴会上，张学良诚恳地对摄政达扎阿旺松绕、阿沛阿旺晋美、五世格达活佛等人道：“这次东北军进入西藏，一来是为了保卫边疆、巩固国防；二来则是帮助西藏人民解除痛苦并建设西藏。东北军在西藏期间，不论是军队官兵还是地方干部，只要做了违犯你们心愿的事或者欺负了你们，你们一定要向我报告，我们马上就改并严惩肇事者。”

阿沛阿旺晋美等人听了后很受感动，都纷纷表示要尽最大的努力为中华民族的团结统一和西藏的建设发展而奋斗下去。

进入5月后，西藏自治区政府在东北边防部驻藏工作人员的协助下开始着手对全西藏展开了脱胎换骨般轰轰烈烈的“土地改革运动”，宣布废除掉农奴制和旧西藏的《十三法典》、《十六法典》等；没收掉旧贵族、地主、土司、官僚的土地、牛羊、财产并分发给广大农奴和没有土地的底层藏民。这样，广大的藏民纷纷翻身得到了解放，由农奴转变为了自由的农民，这无疑极大地刺激藏民们的积极性，促进了西藏农业的飞速发展；同时，由东北边防政府支援的一批现代化的轻工厂和新型中小学校也在西藏的大地上如雨后春笋般拔地而起。随着时间的推移，西藏的面貌愈发焕然一新，公路、机场、建立具有现代工业设备的工厂、银行、贸易公司、邮电局(所)、综合农场等建筑设施遍地开花；同时藏区政府在东北边防政府支持下还向农牧民们无偿分发大量的生产工具，兴修水利，救济受灾群众，向僧尼和乞丐布施，开展公平的贸易活动等等等等；在促进了西藏现代经济力量的增长的时候，也逐步在藏民们中树立了平等、人道的生活方式，这些重大措施都在西藏各阶层中产生了深远影响。

建设西藏的同时，实际控制着大西南的川、滇、黔、康、藏五省的东北边防政府行政部在张学良的授意下展开了对西南诸省行政权的大清洗，以确保东北军对这里的绝对控制权和治理权。其中，重庆市脱离四川省独立为与北平市、天津市平等的全国第三直辖市（此时上海市还归属于江苏省），市长之职位由川军著名爱国将领潘文华上将担任市长；西康省被分成康西、康东两大区域，康东并入四川省，康西并入西藏自治区，原西康省主席刘文辉上将调任四川省副主席。这样，大西南重新被划分为了川、黔、滇三省和重庆直辖市以及西藏自治区，东北军在此驻军约十五万，并拥有当地四十余万新建川军、滇军、滇军、藏军的绝对控制权。

六月一日，中国东北边防政府和中国国防部长张学良上将对外宣布：锡金王国、不丹王国、尼泊尔王国自古以来都是中国神圣不可分割的领土，中国中央政府对三国拥有主权并在不日予以收复。六月三日，驻藏东北军的第260山地作战师开进锡金王国首都甘托克市，锡金国王塔希纳姆伽尔率领锡金王室政府宣布投降，锡金并入中国；六月十日，驻藏东北军的第266山地作战师开入不丹王国首都廷布市，不丹国王吉格梅旺楚克率领王国卫队进行抵抗，但伤亡惨重，卫队死伤过千，迫于东北军的强大军威和军力，吉格梅旺楚克国王被迫宣布不丹王室政府投降，不丹并入中国。

六月十八日，驻藏东北军最精锐的第45机械化快速反应旅从西藏南部的吉隆地区长途奔袭，势如破竹地突入了尼泊尔王国境内，在伞兵和特种部队的配合下于六月二十二日攻占并控制了尼泊尔王国首都加德满都市。此时，尼泊尔沙阿王室的权力已经被贵族纳拉家族给架空并独揽掌握了，首相忠格巴哈杜尔纳拉在东北军兵临城下之时向印度政府和印度英国殖民当局求援，但都遭到了拒绝（英国人和印度人可都不想惹上东北军这么一个强敌）。而只在名义上统治着尼泊尔的沙阿王朝国王特里布万比尔比克拉姆沙阿在得到东北军会帮助其王室权力复兴的承诺后，于23日上午宣布尼泊尔王室政府投降，尼泊尔加入中国。

重新纳入中国版图的尼泊尔、不丹、锡金这高原三国（三国总面积约19.77万平方公里，总人口1200余万）在保留了各自王室权力的情况下，被东北边防政府肢解成了十九个市县并入了中国西藏自治区。【注：历史上的锡金王国和不丹王国都曾是吐蕃国（西藏）的领土，但后来都陆续遭到了英国、印度的侵略；而尼泊尔王国则是与朝鲜、琉球、安南（越南）、苏禄（菲律宾）、缅甸、南掌（老挝）、暹罗（泰国）共为中国皇帝册封的八个附属国（但是现在这些附属国基本上全都欺负到了宗主国的头上来了）；尤其锡金王国（史称哲孟雄），一直是西藏的领土，但后来在近代被英国人分裂出了西藏，目前已经于1975年被印度给吞并掉了，中国政府在2005年正式承认了锡金为印度的一个自治邦的既成事实，是全世界最后一个承认的国家。】而控制了西藏和亚洲高原三国的东北军则获得了进军中南亚以及西亚的战略跳板。战斧已磨砺、战歌已奏起，东北军的兵锋开始指向了东南亚以及缅甸和印度。